网站详情
基本信息
- 收录时间 2025-05-20
- 所属国家 中国
- 全球排名 #-
- 语言支持 中文
- 费用类型 免费 + 高级订阅
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详情介绍
站点名称:国家基因组科学数据中心
站点 URL:http://bigd.big.ac.cn/
Title
Keywords
Description
站点简介
核心功能
- 数据汇交与存储:
提供 GSA Family(GSA、GSA-Human、OMIX)一站式数据归档服务,支持高通量测序、医学影像、植物图像等多类型数据上传,数据安全通过分级管理与加密技术保障。用户可在线提交数据并获取国际认可的唯一编号,直接满足期刊发表要求。
- 多维度数据库检索:
通过跨库搜索引擎 BIG Search 整合 NCBI、EBI 等国际资源,实现全球生物数据的一站式查询。例如,科研人员可快速定位新冠病毒序列(RCoV19 收录超 1,700 万条)或癌症代谢物关联知识(MACdb 涵盖 17 类癌症)。
- 分析工具与知识库:
提供单细胞分析(scTWAS Atlas)、病毒变异预警算法等工具,结合 HervD Atlas(6 万 + HERVs 与疾病关联条目)、BioKA(1.6 万 + 生物标志物)等知识库,支持从数据到知识的转化。例如,医疗机构可通过 CVD Atlas 研究心血管疾病分子机制,植物学家可利用 RefMetaPlant 挖掘生物合成基因簇。
- 国际合作与数据交换:
作为国际生物多样性与健康大数据联盟(BHBD)发起单位,与巴基斯坦、俄罗斯等 12 国建立数据共享机制,推动 “一带一路” 科研合作。GSA 与 NCBI SRA 实现元数据互通,用户可便捷获取全球数据资源。
特点优势
- 权威性与合规性:
GSA 是我国唯一入选 GCBR 的数据库,数据质量获国际认可;GenBase 严格遵循国家人类遗传资源管理条例,确保数据本地化存储与安全共享。
- 技术创新与资源整合:
整合云计算与人工智能技术,支持 PB 级数据的快速分析;2025 年新增 Immunosenescence Inventory、Cyclicpepedia 等数据库,覆盖免疫衰老、环状肽等前沿领域。
- 用户服务与培训支持:
提供定制化数据管理方案与线上培训,累计培训国内外科研人员超 200 人次。针对国际用户,支持多语言界面与跨境数据传输。
- 科研支撑与成果转化:
数据资源直接支撑 3,000 余篇论文发表,包括《Cell》《Nature》等顶级期刊。例如,GSA-Human 为遗传病研究提供关键数据,OBIA 医学影像库助力 AI 辅助诊断模型开发。
适用人群
- 科研机构与高校:
基因组学、生物信息学、临床医学等领域的研究人员,用于数据存储、分析及论文发表支持。例如,植物学家可通过 OPIA 库共享植物图像与性状数据,推动作物遗传改良。
- 医疗机构与药企:
癌症研究团队利用 MACdb 探索代谢物 - 癌症关联机制,药企通过 BioKA 筛选疾病生物标志物,加速药物研发。
- 国际合作项目组:
参与 “一带一路” 科研合作的团队可通过 BHBD 联盟获取全球生物多样性数据,开展跨境流行病学研究。
- 政府与政策制定者:
基于 Database Commons 的全球生物数据库统计数据,制定数据共享政策与科研资助方向。
使用指南
- 注册与登录:
访问官网点击 “注册”,填写机构信息与研究方向,提交后 1-3 个工作日内审核通过。支持微信、邮箱等多方式登录。
- 数据提交流程:
- 选择 “数据汇交” 模块,根据数据类型(如基因组、影像)进入对应子系统。
- 在线填写元数据(项目名称、样本信息等),上传数据文件(支持 FASTQ、BAM 等格式)。
- 提交后系统自动生成唯一编号(如 GSA ID),可同步至论文投稿系统。
- 数据检索与分析:
- 在首页搜索框输入关键词(如 “新冠病毒”),选择 “跨库搜索” 获取全球相关数据。
- 进入 “分析工具” 页面,选择单细胞分析或变异检测工具,上传本地数据或调用云端资源。
- 知识库与文献挖掘:
- 访问 “HervD Atlas” 等专题库,通过知识图谱可视化界面探索 HERVs 与疾病关联网络。
- 使用 “文献挖掘” 功能,输入关键词(如 “免疫衰老”)获取整合分析报告。
常见问题及解决方案
- 数据格式不兼容:
- 问题:提交的 FASTQ 文件因编码错误无法导入系统。
- 解决方案:使用官网提供的 “数据格式转换工具”,将文件转为标准 Illumina 格式;或联系技术支持获取定制化处理。
- 权限申请被拒:
- 问题:申请访问受保护的人类遗传数据时未通过伦理审查。
- 解决方案:补充提交伦理委员会批件扫描件,确保符合《人类遗传资源管理条例》;通过 “在线咨询” 获取模板与指导。
- 国际数据交换延迟:
- 问题:与 NCBI 数据同步耗时过长。
- 解决方案:优先选择 “元数据交换” 模式,仅同步关键信息;或通过 API 接口实现实时数据互通。
- 分析工具运行报错:
- 问题:单细胞分析工具因内存不足崩溃。
- 解决方案:在 “工具设置” 中调整资源分配(如增加 CPU 核心数);或联系技术团队申请专用计算节点。
相关产品推荐
- NCBI(美国国家生物技术信息中心):
全球最权威的生物数据库之一,提供 GenBank、SRA 等资源,适合国际数据比对与文献检索。
- EBI(欧洲生物信息学研究所):
涵盖 ENA(核酸序列)、ArrayExpress(基因表达)等数据库,支持跨平台数据整合与可视化。
- WiggleTools:
开源基因组数据分析工具,支持 bigWig、Bam 等格式,擅长处理高通量测序数据的统计与可视化。
- jcvi:
Python 库,提供基因家族分析、遗传图谱构建等功能,适合生物信息学开发者扩展应用。
- GATK(Genome Analysis Toolkit):
用于变异检测与基因组分析的行业标准工具,尤其适用于肿瘤基因组学研究。
特色功能
AI图片生成
支持自由姿势的商品种草图生成,批量产出差异化、氛围感的商拍图
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图片处理工具
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