国家基因组科学数据中心

bigd.big.ac.cn

更新: 2025-05-20
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基本信息

  • 收录时间 2025-05-20
  • 所属国家 中国
  • 全球排名 #-
  • 语言支持 中文
  • 费用类型 免费 + 高级订阅

功能评分

易用性 9.0/10
功能丰富度 8.8/10
内容质量 9.2/10
性价比 8.5/10

标签分类

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详情介绍

站点名称:国家基因组科学数据中心


站点 URL:http://bigd.big.ac.cn/


Title


国家基因组科学数据中心 - 权威多组学数据存储与共享平台

Keywords


国家基因组科学数据中心,多组学数据共享,GSA 数据库,单细胞组学,癌症代谢物数据库,免疫衰老多组学,生物多样性数据,基因组数据分析工具

Description


国家基因组科学数据中心(NGDC)提供安全合规的一站式组学数据服务,涵盖原始数据归档(GSA)、疾病关联知识库(MACdb、HervD Atlas)及单细胞分析工具。作为全球核心生物数据资源,支持科研项目超 25,000 个,数据量达 60PB,助力发表 SCI 论文 4,300 余篇。免费注册即可享受数据汇交、智能检索及国际合作资源,立即探索生命科学研究新可能!

站点简介


国家基因组科学数据中心(NGDC)是依托中国科学院北京基因组研究所建设的国家级平台,聚焦生命与健康大数据的汇交、存储、共享与挖掘。作为全球核心生物数据资源(GCBR)成员,其组学原始数据归档库(GSA)已支持 25,000 余个科研项目,数据量达 60PB,覆盖 1,200 余家机构 8,000 余名用户。中心构建了完整的多组学数据体系,包括单细胞组学(scTWAS Atlas)、癌症代谢关联(MACdb)、免疫衰老(Immunosenescence Inventory)等 63 个专业数据库,并开发 GenBase 对标国际权威数据库 GenBank,保障我国基因数据主权。其数据编号被 Springer Nature、Cell 等顶级出版集团认可,累计支撑发表论文 4,300 余篇,显著提升我国在生命科学领域的国际话语权

核心功能


  1. 数据汇交与存储
    提供 GSA Family(GSA、GSA-Human、OMIX)一站式数据归档服务,支持高通量测序、医学影像、植物图像等多类型数据上传,数据安全通过分级管理与加密技术保障。用户可在线提交数据并获取国际认可的唯一编号,直接满足期刊发表要求。

  2. 多维度数据库检索
    通过跨库搜索引擎 BIG Search 整合 NCBI、EBI 等国际资源,实现全球生物数据的一站式查询。例如,科研人员可快速定位新冠病毒序列(RCoV19 收录超 1,700 万条)或癌症代谢物关联知识(MACdb 涵盖 17 类癌症)

  3. 分析工具与知识库
    提供单细胞分析(scTWAS Atlas)、病毒变异预警算法等工具,结合 HervD Atlas(6 万 + HERVs 与疾病关联条目)、BioKA(1.6 万 + 生物标志物)等知识库,支持从数据到知识的转化。例如,医疗机构可通过 CVD Atlas 研究心血管疾病分子机制,植物学家可利用 RefMetaPlant 挖掘生物合成基因簇。

  4. 国际合作与数据交换
    作为国际生物多样性与健康大数据联盟(BHBD)发起单位,与巴基斯坦、俄罗斯等 12 国建立数据共享机制,推动 “一带一路” 科研合作。GSA 与 NCBI SRA 实现元数据互通,用户可便捷获取全球数据资源


特点优势


  1. 权威性与合规性
    GSA 是我国唯一入选 GCBR 的数据库,数据质量获国际认可;GenBase 严格遵循国家人类遗传资源管理条例,确保数据本地化存储与安全共享

  2. 技术创新与资源整合
    整合云计算与人工智能技术,支持 PB 级数据的快速分析;2025 年新增 Immunosenescence Inventory、Cyclicpepedia 等数据库,覆盖免疫衰老、环状肽等前沿领域

  3. 用户服务与培训支持
    提供定制化数据管理方案与线上培训,累计培训国内外科研人员超 200 人次。针对国际用户,支持多语言界面与跨境数据传输

  4. 科研支撑与成果转化
    数据资源直接支撑 3,000 余篇论文发表,包括《Cell》《Nature》等顶级期刊。例如,GSA-Human 为遗传病研究提供关键数据,OBIA 医学影像库助力 AI 辅助诊断模型开发


适用人群


  1. 科研机构与高校
    基因组学、生物信息学、临床医学等领域的研究人员,用于数据存储、分析及论文发表支持。例如,植物学家可通过 OPIA 库共享植物图像与性状数据,推动作物遗传改良

  2. 医疗机构与药企
    癌症研究团队利用 MACdb 探索代谢物 - 癌症关联机制,药企通过 BioKA 筛选疾病生物标志物,加速药物研发

  3. 国际合作项目组
    参与 “一带一路” 科研合作的团队可通过 BHBD 联盟获取全球生物多样性数据,开展跨境流行病学研究

  4. 政府与政策制定者
    基于 Database Commons 的全球生物数据库统计数据,制定数据共享政策与科研资助方向


使用指南


  1. 注册与登录
    访问官网点击 “注册”,填写机构信息与研究方向,提交后 1-3 个工作日内审核通过。支持微信、邮箱等多方式登录。

  2. 数据提交流程

    • 选择 “数据汇交” 模块,根据数据类型(如基因组、影像)进入对应子系统。
    • 在线填写元数据(项目名称、样本信息等),上传数据文件(支持 FASTQ、BAM 等格式)。
    • 提交后系统自动生成唯一编号(如 GSA ID),可同步至论文投稿系统。

  3. 数据检索与分析

    • 在首页搜索框输入关键词(如 “新冠病毒”),选择 “跨库搜索” 获取全球相关数据。
    • 进入 “分析工具” 页面,选择单细胞分析或变异检测工具,上传本地数据或调用云端资源。

  4. 知识库与文献挖掘

    • 访问 “HervD Atlas” 等专题库,通过知识图谱可视化界面探索 HERVs 与疾病关联网络。
    • 使用 “文献挖掘” 功能,输入关键词(如 “免疫衰老”)获取整合分析报告。


常见问题及解决方案


  1. 数据格式不兼容

    • 问题:提交的 FASTQ 文件因编码错误无法导入系统。
    • 解决方案:使用官网提供的 “数据格式转换工具”,将文件转为标准 Illumina 格式;或联系技术支持获取定制化处理。

  2. 权限申请被拒

    • 问题:申请访问受保护的人类遗传数据时未通过伦理审查。
    • 解决方案:补充提交伦理委员会批件扫描件,确保符合《人类遗传资源管理条例》;通过 “在线咨询” 获取模板与指导。

  3. 国际数据交换延迟

    • 问题:与 NCBI 数据同步耗时过长。
    • 解决方案:优先选择 “元数据交换” 模式,仅同步关键信息;或通过 API 接口实现实时数据互通。

  4. 分析工具运行报错

    • 问题:单细胞分析工具因内存不足崩溃。
    • 解决方案:在 “工具设置” 中调整资源分配(如增加 CPU 核心数);或联系技术团队申请专用计算节点。


相关产品推荐


  1. NCBI(美国国家生物技术信息中心)
    全球最权威的生物数据库之一,提供 GenBank、SRA 等资源,适合国际数据比对与文献检索。

  2. EBI(欧洲生物信息学研究所)
    涵盖 ENA(核酸序列)、ArrayExpress(基因表达)等数据库,支持跨平台数据整合与可视化。

  3. WiggleTools
    开源基因组数据分析工具,支持 bigWig、Bam 等格式,擅长处理高通量测序数据的统计与可视化

  4. jcvi
    Python 库,提供基因家族分析、遗传图谱构建等功能,适合生物信息学开发者扩展应用

  5. GATK(Genome Analysis Toolkit)
    用于变异检测与基因组分析的行业标准工具,尤其适用于肿瘤基因组学研究。


这些工具与 NGDC 形成互补,可满足从数据存储到深度分析的全流程需求。

特色功能

AI图片生成

支持自由姿势的商品种草图生成,批量产出差异化、氛围感的商拍图

AI文案优化

基于商品信息自动生成高转化率的种草文案,适配不同平台风格

虚拟模特训练

提供丰富的商用AI模特库,支持用户训练专属虚拟模特形象

图片处理工具

集成一键美图、换装、去水印、高清修复等功能,快速提升图片品质

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用户评论 (2,348)

用户头像

张伟

2023-10-10

这是我用过最好的AI对话工具!写作助手功能太强大了,帮我节省了大量时间。特别是写报告和邮件时,它能快速生成高质量内容。

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李婷

2023-10-08

作为程序员,Copilot和ChatGPT是我每天必用的工具。ChatGPT在解释复杂概念和提供算法思路方面特别出色。强烈推荐!

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王教授

2023-10-05

我在教学中使用ChatGPT作为辅助工具,它能快速生成测验问题和解释复杂概念。但学生需要学会批判性思考,不能完全依赖AI的答案。