Array ( [id] => 18940 [title] => Binding靶点蛋白 [url] => https://www.bindingdb.org/bind/index.jsp [pic] => https://cdn.yyp.net/wp-content/uploads/2025/05/20250523084003-b0874.png [desc] => BindingDB 是全球领先的靶点蛋白与小分子相互作用数据库，收录超 150 万条结合数据，覆盖人类、小鼠、大鼠等多物种，支持药物研发全流程。提供高亲和力化合物筛选、靶点验证、生物信息学分析等核心功能，助力研究人员快速定位潜在药物靶点。访问官网获取免费数据下载与 API 接口，加速您的药物发现进程。 [add_time] => 2025-05-20 08:00:00 [content] =>

站点简介


BindingDB 是专注于靶点蛋白与小分子结合数据的权威平台，为药物研发提供一站式解决方案。平台整合了来自全球科研机构的实验数据，涵盖 150 万条化合物 - 蛋白相互作用记录，覆盖人类、小鼠、大鼠等多物种靶点。核心功能包括高亲和力化合物筛选、靶点验证、生物信息学分析等，适用于临床前研究、候选药物优化等场景。研究人员可通过平台快速检索特定靶点的结合数据，或利用机器学习模型（如 GraphBAN）进行未知相互作用预测。

核心功能


  1. 数据检索与筛选

    • 支持按靶点名称、化合物结构、结合亲和力等多维度检索，精准定位目标数据。
    • 提供高亲和力化合物筛选工具，帮助研究人员从海量数据中快速识别潜在药物分子。
    • 支持跨物种数据对比，例如比较人类与小鼠靶点的结合特性，辅助药物安全性评估。

  2. 生物信息学分析

    • 结合基因表达数据库（如 GEO）和通路分析工具（如 KEGG），解析靶点在疾病中的作用机制。
    • 提供分子对接模拟功能，预测化合物与靶点的结合模式及亲和力，减少实验成本。

  3. 机器学习训练支持

    • 开放 API 接口，允许研究人员直接调用数据训练 AI 模型（如 GraphBAN），用于预测未知化合物 - 蛋白相互作用。
    • 提供标准化数据集，支持跨域药物发现研究，例如从已知靶点扩展至 “不可成药” 靶点（如 PRL3、KRASG12D）。


特点优势


  1. 数据全面性

    • 收录数据涵盖 150 万条化合物 - 蛋白相互作用记录，覆盖 HER2、EGFR、TROP2 等热门靶点，以及 LIV-1 等新兴靶点。
    • 整合多源数据，包括文献、高通量筛选结果和临床试验数据，确保信息的准确性和时效性。

  2. 技术创新性

    • 采用分布式数据库架构，支持高效数据检索和多模态数据融合（如结构数据、序列数据）。
    • 提供可视化工具，直观展示靶点 - 化合物相互作用网络，辅助研究人员理解分子机制。

  3. 用户友好性

    • 界面简洁易用，支持 SMILES、FASTA 等多种格式输入，降低技术门槛。
    • 提供免费数据下载和 API 访问，满足学术研究与工业界需求。


适用人群


  1. 药物研发人员

    • 用于靶点筛选、化合物优化、临床前研究等阶段，加速候选药物发现进程。
    • 例如，在 ADC 药物开发中，可通过 BindingDB 筛选与 TROP2、Claudin18.2 等高表达靶点结合的高亲和力抗体。

  2. 生物信息学研究者

    • 利用平台数据进行靶点预测、通路分析和机器学习模型训练。
    • 例如，通过整合 BindingDB 与 TCMSP 数据库，解析中药活性成分的作用靶点。

  3. 临床医生与转化医学团队

    • 辅助靶点验证和个性化治疗方案设计，例如通过分析肿瘤患者靶点表达数据，匹配最佳治疗药物。


使用指南


  1. 数据检索

    • 访问官网后，在搜索栏输入靶点名称（如 “HER2”）或化合物结构（SMILES 格式），点击 “搜索”。
    • 使用筛选器（如结合亲和力范围、物种、实验类型）缩小结果范围。

  2. 生物信息学分析

    • 点击目标靶点进入详情页，查看相关基因表达数据、通路富集结果及分子对接模型。
    • 下载数据后，可使用 R 语言或 Python 进行进一步分析（如 GO 功能富集、PPI 网络构建）。

  3. API 调用

    • 注册账号后，在 “开发者工具” 页面获取 API 密钥。
    • 使用 curl 或 Python 请求示例代码，调用数据接口（如GET /api/bindings?target=EGFR）。


常见问题及解决方案


  1. 数据格式不兼容

    • 问题：下载的 CSV 文件无法在本地分析工具中打开。
    • 解决：使用 Excel 或 Python 的 pandas 库转换为所需格式，或联系客服获取定制化数据。

  2. 搜索结果为空

    • 问题：输入靶点名称后未返回任何结果。
    • 解决：检查拼写是否正确，尝试使用同义词（如 “ERBB2” 代替 “HER2”），或扩大筛选范围（如取消亲和力限制）。

  3. API 访问权限不足

    • 问题：调用 API 时返回 “403 Forbidden” 错误。
    • 解决：确认 API 密钥正确，并在开发者控制台申请更高权限（如学术研究或商业用途）。


相关产品推荐


  1. ChEMBL

    • 特点：聚焦药物化学数据，提供化合物活性、毒性及药代动力学信息。
    • 适用场景：药物化学结构优化、ADMET 性质预测。

  2. DrugBank

    • 特点：整合药物与靶点信息，提供详细的药物说明书和临床试验数据。
    • 适用场景：药物机制研究、临床用药参考。

  3. STRING

    • 特点：专注蛋白质 - 蛋白质相互作用网络分析，支持功能富集和通路解析。
    • 适用场景：靶点作用机制研究、多靶点药物开发。


以上产品可与 BindingDB 互补使用，例如结合 ChEMBL 的药物化学数据和 BindingDB 的靶点结合信息，加速候选药物筛选。

[click] => 499770 [seo_title] => BindingDB：全球权威靶点蛋白与小分子结合数据平台 [seo_metakey] => 靶点蛋白数据库，小分子结合数据，药物研发，高亲和力化合物，临床前研究，靶点验证，结合亲和力，生物信息学分析，机器学习训练数据，跨物种数据整合 [seo_desc] => BindingDB 是全球领先的靶点蛋白与小分子相互作用数据库，收录超 150 万条结合数据，覆盖人类、小鼠、大鼠等多物种，支持药物研发全流程。提供高亲和力化合物筛选、靶点验证、生物信息学分析等核心功能，助力研究人员快速定位潜在药物靶点。访问官网获取免费数据下载与 API 接口，加速您的药物发现进程。 [tags] => Array ( [0] => AIGC工具导航 [1] => Binding靶点蛋白 [2] => 机器学习训练数据 [3] => 药物研发 [4] => 生物信息学分析 [5] => 靶点蛋白数据库 [6] => 小分子结合数据 [7] => 高亲和力化合物 [8] => 临床前研究 [9] => 靶点验证 [10] => 结合亲和力 [11] => 跨物种数据整合 ) )
老哥⦁经典AI导航
Binding靶点蛋白

Binding靶点蛋白

www.bindingdb.org

更新: 2025-05-20
访问: 499,770次
访问网站

网站详情

基本信息

  • 收录时间 2025-05-20
  • 所属国家 中国
  • 全球排名 #-
  • 语言支持 中文
  • 费用类型 免费 + 高级订阅

功能评分

易用性 9.0/10
功能丰富度 8.8/10
内容质量 9.2/10
性价比 8.5/10

标签分类

AIGC工具导航 Binding靶点蛋白 机器学习训练数据 药物研发 生物信息学分析 靶点蛋白数据库 小分子结合数据 高亲和力化合物 临床前研究 靶点验证 结合亲和力 跨物种数据整合

详情介绍

  • 站点名称：Binding 靶点蛋白数据库
  • 站点 URL：https://www.bindingdb.org/bind/index.jsp
  • Title：BindingDB：全球权威靶点蛋白与小分子结合数据平台
  • Keywords：靶点蛋白数据库，小分子结合数据，药物研发，高亲和力化合物，临床前研究，靶点验证，结合亲和力，生物信息学分析，机器学习训练数据，跨物种数据整合
  • Description：BindingDB 是全球领先的靶点蛋白与小分子相互作用数据库，收录超 150 万条结合数据，覆盖人类、小鼠、大鼠等多物种，支持药物研发全流程。提供高亲和力化合物筛选、靶点验证、生物信息学分析等核心功能，助力研究人员快速定位潜在药物靶点。访问官网获取免费数据下载与 API 接口，加速您的药物发现进程。

站点简介


BindingDB 是专注于靶点蛋白与小分子结合数据的权威平台，为药物研发提供一站式解决方案。平台整合了来自全球科研机构的实验数据，涵盖 150 万条化合物 - 蛋白相互作用记录，覆盖人类、小鼠、大鼠等多物种靶点。核心功能包括高亲和力化合物筛选、靶点验证、生物信息学分析等，适用于临床前研究、候选药物优化等场景。研究人员可通过平台快速检索特定靶点的结合数据，或利用机器学习模型（如 GraphBAN）进行未知相互作用预测。

核心功能


  1. 数据检索与筛选

    • 支持按靶点名称、化合物结构、结合亲和力等多维度检索，精准定位目标数据。
    • 提供高亲和力化合物筛选工具，帮助研究人员从海量数据中快速识别潜在药物分子。
    • 支持跨物种数据对比，例如比较人类与小鼠靶点的结合特性，辅助药物安全性评估。

  2. 生物信息学分析

    • 结合基因表达数据库（如 GEO）和通路分析工具（如 KEGG），解析靶点在疾病中的作用机制。
    • 提供分子对接模拟功能，预测化合物与靶点的结合模式及亲和力，减少实验成本。

  3. 机器学习训练支持

    • 开放 API 接口，允许研究人员直接调用数据训练 AI 模型（如 GraphBAN），用于预测未知化合物 - 蛋白相互作用。
    • 提供标准化数据集，支持跨域药物发现研究，例如从已知靶点扩展至 “不可成药” 靶点（如 PRL3、KRASG12D）。


特点优势


  1. 数据全面性

    • 收录数据涵盖 150 万条化合物 - 蛋白相互作用记录，覆盖 HER2、EGFR、TROP2 等热门靶点，以及 LIV-1 等新兴靶点。
    • 整合多源数据，包括文献、高通量筛选结果和临床试验数据，确保信息的准确性和时效性。

  2. 技术创新性

    • 采用分布式数据库架构，支持高效数据检索和多模态数据融合（如结构数据、序列数据）。
    • 提供可视化工具，直观展示靶点 - 化合物相互作用网络，辅助研究人员理解分子机制。

  3. 用户友好性

    • 界面简洁易用，支持 SMILES、FASTA 等多种格式输入，降低技术门槛。
    • 提供免费数据下载和 API 访问，满足学术研究与工业界需求。


适用人群


  1. 药物研发人员

    • 用于靶点筛选、化合物优化、临床前研究等阶段，加速候选药物发现进程。
    • 例如，在 ADC 药物开发中，可通过 BindingDB 筛选与 TROP2、Claudin18.2 等高表达靶点结合的高亲和力抗体。

  2. 生物信息学研究者

    • 利用平台数据进行靶点预测、通路分析和机器学习模型训练。
    • 例如，通过整合 BindingDB 与 TCMSP 数据库，解析中药活性成分的作用靶点。

  3. 临床医生与转化医学团队

    • 辅助靶点验证和个性化治疗方案设计，例如通过分析肿瘤患者靶点表达数据，匹配最佳治疗药物。


使用指南


  1. 数据检索

    • 访问官网后，在搜索栏输入靶点名称（如 “HER2”）或化合物结构（SMILES 格式），点击 “搜索”。
    • 使用筛选器（如结合亲和力范围、物种、实验类型）缩小结果范围。

  2. 生物信息学分析

    • 点击目标靶点进入详情页，查看相关基因表达数据、通路富集结果及分子对接模型。
    • 下载数据后，可使用 R 语言或 Python 进行进一步分析（如 GO 功能富集、PPI 网络构建）。

  3. API 调用

    • 注册账号后，在 “开发者工具” 页面获取 API 密钥。
    • 使用 curl 或 Python 请求示例代码，调用数据接口（如GET /api/bindings?target=EGFR）。


常见问题及解决方案


  1. 数据格式不兼容

    • 问题：下载的 CSV 文件无法在本地分析工具中打开。
    • 解决：使用 Excel 或 Python 的 pandas 库转换为所需格式，或联系客服获取定制化数据。

  2. 搜索结果为空

    • 问题：输入靶点名称后未返回任何结果。
    • 解决：检查拼写是否正确，尝试使用同义词（如 “ERBB2” 代替 “HER2”），或扩大筛选范围（如取消亲和力限制）。

  3. API 访问权限不足

    • 问题：调用 API 时返回 “403 Forbidden” 错误。
    • 解决：确认 API 密钥正确，并在开发者控制台申请更高权限（如学术研究或商业用途）。


相关产品推荐


  1. ChEMBL

    • 特点：聚焦药物化学数据，提供化合物活性、毒性及药代动力学信息。
    • 适用场景：药物化学结构优化、ADMET 性质预测。

  2. DrugBank

    • 特点：整合药物与靶点信息，提供详细的药物说明书和临床试验数据。
    • 适用场景：药物机制研究、临床用药参考。

  3. STRING

    • 特点：专注蛋白质 - 蛋白质相互作用网络分析，支持功能富集和通路解析。
    • 适用场景：靶点作用机制研究、多靶点药物开发。


以上产品可与 BindingDB 互补使用，例如结合 ChEMBL 的药物化学数据和 BindingDB 的靶点结合信息，加速候选药物筛选。

特色功能

AI图片生成

支持自由姿势的商品种草图生成，批量产出差异化、氛围感的商拍图

AI文案优化

基于商品信息自动生成高转化率的种草文案，适配不同平台风格

虚拟模特训练

提供丰富的商用AI模特库，支持用户训练专属虚拟模特形象

图片处理工具

集成一键美图、换装、去水印、高清修复等功能，快速提升图片品质

相关推荐

TLC标准品

TLC标准品

http://tlcstandards.com/ProductsRS.aspx

专业提供高纯度 TLC 标准品，适配薄层色谱分析全流程！涵盖药物研发、环境监测、食品检测等场景，支持定制合成服务，符合 ...

AIGC工具导航

国家微生物资源平台

http://www.nimr.org.cn/

国家微生物资源平台提供全面的微生物菌种保藏、基因组数据查询及科研服务，支持在线申请与数据分析，助力微生物研究与产业应用。...

AIGC工具导航
AMBER

AMBER

http://ambermd.org/

AMBER 专注于医疗领域前沿技术，提供分子动力学模拟工具及癌症早筛解决方案。结合 AI 算法与甲基化检测技术，助力科研...

AIGC工具导航
Nature药物发现

Nature药物发现

https://www.nature.com/nrd/articles?type=review-article

聚焦全球药物研发动态，Nature 药物发现提供高质量综述，涵盖靶点识别、临床前研究及创新疗法。权威专家解读最新趋势，助...

AIGC工具导航

用户评论 (2,348)

用户头像

张伟

2023-10-10 •

这是我用过最好的AI对话工具！写作助手功能太强大了，帮我节省了大量时间。特别是写报告和邮件时，它能快速生成高质量内容。

用户头像

李婷

2023-10-08 •

作为程序员，Copilot和ChatGPT是我每天必用的工具。ChatGPT在解释复杂概念和提供算法思路方面特别出色。强烈推荐！

用户头像

王教授

2023-10-05 •

我在教学中使用ChatGPT作为辅助工具，它能快速生成测验问题和解释复杂概念。但学生需要学会批判性思考，不能完全依赖AI的答案。

热门AI工具榜

1

FreeOK

智能推荐 • 1,831,868,327次浏览

2

yymanhua

免费漫画 • 1,050,998,890次浏览

3

谷歌搜索镜像

搜索 • 451,281,730次浏览

4

爱达杂货铺

设计软件 • 360,343,925次浏览

5

24h搜书网

无广告阅读 • 336,956,410次浏览

查看完整榜单

推荐工具

txt小说网

小说下载 • txt小说网(www.t...

自媒体Ai爆文创作

免费去 Ai 改写提供高...

Cursor

多语言支持 • Cursor 是一款基于...

米兔音乐

免费 • 米兔音乐提供免费在线音乐...

promptpilot提示词优化

自然语言处理 • PromptPilot ...

热门标签

AIGC工具导航 API 集成 多模态生成 AI 模特生成 虚拟模特生成 电商图片编辑工具 AI 营销内容制作 免费 增值 免费试用 付费 多语言支持 企业级 AI 解决方案 AI 写作助手 自然语言处理 AI 内容生成工具 询问价格 多模态交互 创意设计 办公提效 内容创作工具 AI 写作工具 多语言内容生成 人工智能 开放获取论文 AI 图像生成 SEO 优化标题 社交媒体标题生成 免费标题生成 免费在线游戏 AI 视频生成工具 AI 标题生成器 多平台支持 AI 聊天机器人 多语言标题生成 写作助手 标题心情设置 实时数据分析标题 学术交流平台 AI 营销自动化 智能客服系统 全渠道客户互动 客户生命周期管理 个性化营销活动 自动化客户旅程 电商复购率提升 预印本平台 高端品牌形象设计 企业标识定制 国际品牌设计服务