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国家基因科学数据中心

国家基因科学数据中心

ngdc.cncb.ac.cn

更新: 2025-05-20
访问: 493,002次
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基本信息

  • 收录时间 2025-05-20
  • 所属国家 中国
  • 全球排名 #-
  • 语言支持 中文
  • 费用类型 免费 + 高级订阅

功能评分

易用性 9.0/10
功能丰富度 8.8/10
内容质量 9.2/10
性价比 8.5/10

标签分类

AIGC工具导航 国家基因科学数据中心 多组学数据整合 数据共享平台 科研合作 基因组数据分析工具 基因数据中心 生物信息学数据库 新冠病毒基因组数据库 表观组关联分析 中医药基因组数据 农业基因组数据

详情介绍


Title


国家基因科学数据中心 - 权威基因组数据共享与分析平台

Keywords


基因数据中心，生物信息学数据库，基因组数据分析工具，数据共享平台，科研合作，多组学数据整合，新冠病毒基因组数据库，表观组关联分析，中医药基因组数据，农业基因组数据

Description


国家基因科学数据中心（NGDC）是中国科技部认定的国家级平台，提供基因组数据汇交、存储、分析及全球共享服务。依托高性能计算资源（3,720 万亿次 / 秒）和自主开发的 GSA 数据库体系，支持科研项目数据管理、多组学整合分析及新冠病毒监测。平台被国际顶级期刊认可，覆盖人、动植物、微生物等多领域数据，助力科研创新与国际合作。

站点简介


国家基因科学数据中心（NGDC）成立于 2019 年，依托中国科学院北京基因组研究所，是国家级生命与健康大数据枢纽。中心面向人口健康和可持续发展需求，构建了覆盖数据汇交、存储、共享与挖掘的全链条体系，支持国家重点研发计划等 17,000 余个项目，数据总量达 40PB。其核心优势包括：

  1. 国际领先的技术能力：拥有 108PB 存储资源和生物大数据云计算平台，支持高通量测序数据处理及多组学整合分析；
  2. 权威数据资源库：涵盖基因组、转录组、表观组等 9 大类 63 个数据库，与 NCBI、EBI 并列全球主要生物数据中心；
  3. 数据安全与主权保障：开发国内首个组学原始数据管理体系（GSA Family），被 Springer Nature 等国际出版机构推荐，解决我国数据长期依赖国际平台的问题。

核心功能


  1. 多组学数据管理

    • 支持基因、蛋白、代谢等多类型数据提交，提供标准化注释和元数据整合，例如表观组关联分析数据库 EWAS Data Hub 整合 7.5 万样本数据，消除批次效应；
    • 新冠病毒信息库 RCoV19 收录 1100 万条序列，提供突变注释、演化支系分析及高风险株预警，服务全球 181 个国家科研人员。

  2. 数据分析与工具

    • 在线分析平台 BIT 集成 BLAST 等工具，支持序列比对、基因表达分析等 6 大专题，降低科研门槛；
    • 跨库搜索引擎 BIG Search 实现 NCBI、EBI 等国际资源一站式检索，提升数据获取效率。

  3. 科研协作与共享

    • 发起国际生物多样性与健康大数据联盟（BHBD），联合 12 国 28 家机构推动数据开放，已合作发表论文 10 余篇；
    • 支持国家人类遗传资源本地化存储，确保数据主权安全。


特点优势


  1. 权威性与国际认可

    • 被《核酸研究》列为全球三大生物数据中心之一，GSA 系统支撑 3,000 余篇论文发表，覆盖 CNS 等顶级期刊；
    • 新冠病毒数据服务获 WHO 认可，为全球溯源研究提供关键支持。

  2. 技术创新与高性能支撑

    • 自主研发基因组数据管理系统，支持从 PB 级原始数据到知识图谱的全流程处理；
    • 高性能计算平台实现 WGS 分析时间从 30 小时缩短至 5 小时，资源利用率显著提升。

  3. 细分领域深度覆盖

    • 设立中医药、农业、海洋等 9 个分中心，例如中医药分中心聚焦中药基因组数据整合，助力精准医疗；
    • 支持叶绿体基因组分析工具 CPStools 等细分领域应用，提升科研效率。


适用人群


  1. 科研机构与高校：

    • 基因组学、生物信息学研究人员可通过平台提交数据、获取分析工具，支撑论文发表与项目验收；
    • 例如，新冠病毒研究团队利用 RCoV19 数据完成突变效应分析，推动防控策略制定。

  2. 生物医药企业：

    • 制药公司可通过多组学数据挖掘靶点，加速新药研发；农业企业可利用动植物基因组数据优化育种方案。

  3. 医疗机构与公共卫生部门：

    • 医院可通过平台获取遗传病基因数据，辅助临床诊断；疾控机构可利用新冠病毒监测工具预警高风险变异株。


使用指南


  1. 数据提交流程

    • 注册并登录平台，选择对应数据库（如 GSA、GenBase）；
    • 按模板填写元数据，上传测序文件（支持 Fastq、Bam 等格式），提交后系统自动校验并生成唯一标识符。

  2. 数据分析路径

    • 访问 BIT 平台，选择分析工具（如序列比对、表观组分析）；
    • 上传数据或调用已有数据集，配置参数后提交任务，结果可下载或可视化展示。

  3. 国际合作支持

    • 加入 BHBD 联盟需提交机构资质，通过审核后可参与数据共享与联合研究；
    • 与 NCBI、EBI 数据交换可通过 BIG Search 实现，无需重复检索。


常见问题及解决方案


  1. 数据格式错误

    • 问题：提交文件不符合 GSA 要求（如缺失注释文件）。
    • 解决：使用平台提供的模板生成元数据，或联系技术支持获取格式校验工具。

  2. 分析结果异常

    • 问题：BLAST 比对结果与预期不符。
    • 解决：检查参数设置（如物种限定、相似度阈值），或改用 BIT 平台的智能推荐参数模式。

  3. 数据访问权限

    • 问题：无法下载受保护数据。
    • 解决：提交数据使用申请，需提供科研项目证明或伦理审查文件，经审核后开放访问。


相关产品推荐


  1. 国家基因库生命大数据平台（CNGBdb）：

    • 国内领先的生物大数据中心，支持动植物、微生物多组学数据存储与分析，与 NGDC 形成互补。

  2. CODEPLOT 可信计算平台：

    • 提供生物信息分析一站式服务，支持自动化工作流与弹性云计算，适合复杂基因组项目。

  3. CPStools 叶绿体基因组分析工具：

    • 专用于叶绿体基因组注释、多态性分析，简化科研流程，提升数据准确性。

  4. NCBI 与 EBI 数据库：

    • 国际权威生物数据平台，与 NGDC 数据互通，可作为补充资源。



以上内容基于国家基因科学数据中心的核心定位与技术特点，自然融入 “基因组数据”“生物信息学” 等关键词，同时覆盖细分领域如中医药、农业基因组，符合 SEO 最佳实践。内容结构清晰，突出权威性与实用性，满足科研人员、企业用户等不同群体的需求。

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用户评论 (2,348)

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张伟

2023-10-10 •

这是我用过最好的AI对话工具！写作助手功能太强大了，帮我节省了大量时间。特别是写报告和邮件时，它能快速生成高质量内容。

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李婷

2023-10-08 •

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王教授

2023-10-05 •

我在教学中使用ChatGPT作为辅助工具，它能快速生成测验问题和解释复杂概念。但学生需要学会批判性思考，不能完全依赖AI的答案。

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